Nasveti za odkrivanje COVID-19

Da bi podprli odkrivanje novega koronavirusa (COVID-19) in raziskave in razvoj cepiva, so ameriški centri za nadzor in preprečevanje bolezni (CDC) in kitajska vlada zaključili zaporedje novega genoma koronavirusa in rezultate posredovali ameriškemu NCBI GenBank ® baze podatkov]. Pred kratkim je IDT prejel poizvedbe raziskovalcev po vsem svetu o novem kompletu za odkrivanje koronavirusa. Sledi kratek opis.

Ameriški centri za nadzor in preprečevanje bolezni

Ameriški centri za preskusni komplet za nadzor in preprečevanje bolezni * Ciljno usmerja različna mesta v genomu proteina COVID-19 (N-gen) nukleokapsida. Tri sklope prajmov / sond v tem kompletu je treba izvajati hkrati z notranjim nadzorom, usmerjenim na človeški gen RNase P. Za vsak vzorec pacienta je potrebnih 4 qPCR testov.

1. Komplet za odkrivanje uporablja enostopenjsko reakcijo qPCR (to pomeni, da sta v istem koraku končana povratna transkripcija in nadaljnje reakcije qPCR);

2. Vsi 3 N-genski testi se lahko štejejo za pozitiven rezultat le, ko Cq 0010010 lt; 35;

3. Ključna je reakcija notranje kontrole RNase P. Cq 0010010 gt; 3 5 pomeni, da odvzem vzorca ni dober in da je treba poskus ponoviti;

Za ustrezne dokumente in eksperimentalne protokole glejte najnovejše ameriške centre za nadzor in preprečevanje bolezni COVID-19 RT-PCR Test Laboratorijska metoda.

Primerjava z drugimi testnimi kompleti

Svetovna zdravstvena organizacija (WHO)

Eksperimentalni program Svetovne zdravstvene organizacije se razlikuje od eksperimentalnega programa ameriških centrov za nadzor in preprečevanje bolezni. Svetovna zdravstvena organizacija priporoča tri reakcije qPCR za potrditev, ali je COVID-19 okužen. Čeprav gre za celoten sklop eksperimentalnih protokolov, ne obstaja ameriška metoda testiranja CDC, ki bi bila hitrejša, ker zahteva tri zaporedne teste, pred naslednjim testom pa je treba upoštevati pozitiven rezultat. Poskusni protokol se preskusi v naslednjem vrstnem redu:

1. Koronavirusni E-gen

2. RdRP gen: ciljanje na koronavirus SARS in drugi koronavirus, povezan z netopirjem

3. RdRP gen: ciljanje na COVID-19

Kitajski center za nadzor in preprečevanje bolezni

Komplet za odkrivanje kitajskega centra za nadzor in preprečevanje bolezni priporoča uporabo 2 sklopov prajmov / sond. Skupina 1 cilja ORF 1 ab, skupina 2 pa se uporablja za potrditev gena N COVID-19.

Nadzorna skupina

Predhodna elektronska simulacijska analiza kaže, da je kombinacija IDT N-gena pozitivne kontrolne predloge ** in ameriškega testnega kompleta CDC podobna uporabi kompletov temeljnih / sondnih kitajskih CDC, tajskega ministrstva za zdravje in HKU s poskusom so dosledni. Seveda to temelji na elektronskih simulacijah, zato je priporočljivo, da izbrani komplet preverijo v svojem laboratoriju.

Za več informacij obiščite www.idtdna.com/pages/landing/coronavirus-research-reagents